לימודי התואר השני בפסיכולוגיה רפואית מתמקדים בהבנת הקשר בין המשתנים הפיזיולוגיים לבין המשתנים הפסיכולוגיים והחברתיים המעורבים בהתפתחות תופעות ומחלות גופניות, דרכי התמודדויות איתן ומניעתן בילדים, בוגרים ובגיל השלישי. 

בסיום התואר נדרש מהסטודנטים להגיע להבנה מעמיקה והבנה של יחסי הגומלין בין תהליכים גופניים, נפשיים וחברתיים תוך התבוססות על הכרת מודל וגישות תיאורטיות בתחום הפסיכולוגיה הרפואית. המסלול לפסיכולוגיה רפואית שואף להקנות ללומדים כלים ומיומנויות בשיטות של ראיון ובכלי אבחון והערכה על מנת לקיים ראיון יעיל מול המטופל ולאבחן אותו. תכנית הלימודים תאפשר לבוגריה ליישם מיומנויות שונות וטכניקות מתחום הפסיכולוגיה הרפואית שיסייעו להם בבניית תכניות טיפוליות וכן בעבודה בצוות.

לימודי תואר שני בפסיכולוגיה רפואית מתאימים לבוגרי תואר ראשון בפסיכולוגיה אשר מעוניינים לעבוד בבתי חולים ולהיות חלק מהצוות הרפואי. הלימודים אינטנסיביים ורמת הקושי של הלימודים גבוהה מהרגיל, לכן הם מתאימים למי שמוכן לכך ובעל נכונות להשקיע. מדובר במקצוע מורכב הכולל מונחים מתחום הרפואה, ולכן לרוב מתאים למועמדים שתחום הרפואה מעניין אותם.

בתום הלימודים ישתלבו הבוגרים בבתי חולים וייחשפו למראות קשים ומצבים נפשיים קשים, דבר שדורש מהמועמדים אופי חזק ויכולת לשאת מראות מסוג זה. העבודה כפסיכולוג רפואי היא עבודה מול חולים במצב רגיש, לכן על המועמדים להיות בעלי יחסי אנוש ברמה גבוהה שתאפשר להם להתנהל מול החולים ולתת להם שירות טוב ומועיל.

לימודי תואר שני בפסיכולוגיה רפואית מיועדים לבוגרי תואר ראשון בפסיכולוגיה. רבים מתמודדים על האפשרות להמשיך ללימודים אלו ולכן מוסדות הלימוד מציבים תנאי קבלה נוקשים. המועמדים נדרשים להציג ציוני תואר ראשון בפסיכולוגיה בממוצע 85-90 לכל הפחות, כתלות במוסד הלימודים, ולהיבחן בבחינת מתא"ם (בחינה המיועדת למועמדים לתואר שני בפסיכולוגיה).

 

בכמו כן, מוסדות הלימוד השונים לעיתים קרובות דורשים גם כתנאי קבלה מכתבי המלצה, ראיונות אישיים וועדות קבלה ועוד.
חשוב לציין כי תנאי הקבלה משתנים מעת לעת וממוסד לימודים אחד למשנהו, לכן מומלץ לבדוק תנאי הקבלה מול מזכירות החוג במוסד הלימודים הרלוונטים. 

משך לימודי תואר מוסמך אוניברסיטה בפסיכולוגיה קלינית יכולים להשתנות בין מוסד לימודים אחד למשנהו, אך באופן כללי ניתן לומר כי הלימודים נמשכים כשנתיים, בסיום הלימודים ממשיכים הבוגרים להתמחות בתחום. רוב המוסדות מציעים שני מסלולים ללימודי פסיכולוגיה רפואית: מסלול מחקרי הכולל הגשת תזה ומסלול עיוני שאינו כולל הגשת תזה. לרוב המסלול המחקרי אורך זמן רב יותר. 

חשוב לדעת כי חלק ממוסדות הלימוד מציעים השתלבות במסלול הלימודים במתכונת של לימודי ערב או/ו לימודים בימי שישי בוקר. אפשרות זו מאפשרת עבור המעוניינים לרכוש הכשרה זו אך אין ביכולתם לפנות את יומם לטובת הלימודים עקב התחייבויות קודמות כמו עבודה, לימודים או כל התחייבות אחרת. כך יוכלו ללמוד בשעות ובזמנים המתאימים להם ביותר.

לימודי תואר שני בפסיכולוגיה רפואית הינם לימודים מאתגרים ומרתקים, הסטודנטים נחשפים לנושאים רבים אשר תורמים להכשרתם המקצועית. בין נושאי הלימוד ניתן למצוא: גורמים פסיכולוגיים והשפעתם על מחלקות, דינמיקה בין החולה לצוות, השפעת גורמים פסיכולוגים על מערכת החיסון, התמודדות מול מחלות ועוד. כמו כן, במהלך לימודיהם, הסטודנטים צריכים להשתתף בהכשרה מעשית הקרויה פרקטיקום ולהגיש עבודת גמר.

בין הקורסים שיועברו במהלך לימודי תואר שני בפסיכולוגיה רפואית: מודלים ותאוריות מרכזיות בפסיכולוגיה רפואית, מחלות גופניות, מוח והתנהגות, סוגיות אתיות נבחרות בפסיכולוגיה, טיפול פסיכו-רפואי בפרט ובמשפחה, התערבויות פסיכולוגיות במערכת הרפואית, ראיון בפסיכולוגיה רפואית ועוד.
חשוב לציין כי נושאי הלימוד והקורסים השונים משתנים מעת לעת ובין מוסד לימודים אחד למשנהו ולכן מומלץ לעיין בסילבוס החוג טרם תחילת הלימודים.

בוגרי תואר שני בפסיכולוגיה רפואית הינם אנשים מקצוע מבוקשים בשוק העבודה ועומדות בפניהם אפשרויות תעסוקה שונות ומגוונות, הם יכולים להשתלב כפסיכולוגים רפואיים בבתי חולים, במוסדות שיקומיים, במרפאות פרטיות וציבוריות וכדומה. תפקיד הפסיכולוג הרפואי הוא לסייע לצוות הרפואי ולחולים להתמודד מול מצבם הנפשי בעקבות שינויים פיזיים שקרו בעקבות תאונה, מחלה, קטיעת איבר וכדומה. הפסיכולוגיה הרפואית משלבת בין הענף הטיפולי לענף המחקרי, לכן בוגרי התואר יוכלו לעסוק במחקר של התחום במוסדות האקדמיים השונים.

בנוסף, בוגרי המסלול המחקרי יוכלו להמשיך ללימודי תואר שלישי. בסיום לימודי הדוקטורט יוכלו הבוגרים להשתלב במוסדות להשכלה גבוהה כמרצים וחוקרים מן השורה ולעשות בהוראת המקצוע ובמחקר מעמיק בתחומים שונים. 

בוגרי תואר מוסמך אוניברסיטה בפסיכולוגיה רפואית אשר סיימו את לימודיהם במסלול המחקרי, אשר כולל הגשת עבודת גמר מחקרית (תזה), יוכלו להמשיך ללימודי תואר שלישי. בוגרי המסלול העיוני, שאינו דורש הגשת תזה, יידרשו בהשלמות המכשירות אותם לביצוע מחקר עצמאי טרם לימודי הדוקטורט. 
תנאי הקבלה לתואר שלישי בפסיכולוגיה משתנים ממוסד לימודים אחד למשנהו, אך ניתן לומר בכלליות כי על המועמדים להציג ממוצע ציונים של 85 לכל הפחות בתואר השני וכן להגיש נושא מחקר, למצוא מנחה למחקר ולעיתים קיימות דרישות נוספות כגון מעבר ראיון אישי וועדת קבלה.

בפני מסיימי מסלול הדוקטורט יעמדו אפשרויות תעסוקה רבות ומגוונות, הם יוכלו להשתלב בסגל ההוראה והמחקר במוסדות להשכלה גבוהה ולשמש כמרצים וחוקרים מן המניין.