במהלך תואר שני בלימודי ארץ ישראל ירכשו הסטודנטים ידע נרחב על ארץ ישראל לאורך ההיסטוריה. כחלק מניתוח הגורמים והתהליכים שעיצבו את התרבות בארץ ישראל בתקופות מוקדמות הם יבחנו אירועים אקטואליים בפרספקטיבה רחבה. בתואר השני ירחיבו הסטודנטים את ידיעתם בתחומים השונים הנוגעים לארץ ישראל, למשל בהיסטוריה גיאוגרפית, באנתרופולוגיה ובסוגיות פוליטיות הנוגעות במדינת ישראל.

נוסף על כך, הסטודנטים יוכלו לבחור להתמקד בנושאים ספציפיים יותר כמו ארץ ישראל בעת החדשה ובעת העתיקה, חקר הדתות בארץ ישראל, ארכיאולוגיה ארץ ישראלית ועוד, בהתאם למסלול הלימודים. בוגרי תואר ראשון בתחום לימוד שאינו שייך ללימודי ארץ ישראל יידרשו לרוב להשלים קורסים נחוצים בנוסף לתוכנית הלימודים הרגילה. בוגרי התואר יוכלו להשתלב במחקר אקדמי, להיות מורי דרך, לעסוק בהוראה במכללות אקדמיות ובאוניברסיטאות ועוד.

מסלול זה מתאים בראש ובראשונה לאנשים שמגלים עניין רב בארץ ישראל, בהיסטוריה שלה, בניתוח תהליכים שקרו בה ולאלו שמעוניינים להרחיב את הידע שלהם על אודותיה אף יותר. כמו כן, על מנת להתקבל לתואר שני יש להיות בוגר תואר ראשון בלימודי ארץ ישראל במקרים רבים. אולם, גם בוגרי תואר ראשון בהיסטוריה למשל ובתחומים דומים יכולים לרוב להתקבל, בכפוף להשלמת קורסים לאורך הלימודים.

כמו כן, במוסדות לימוד רבים הלימודים מתקיימים לאורך יום מרוכז אחד בשבוע. כך, גם אנשים עובדים, בעלי משפחות וכאלו בעלי התחייבויות קודמות עדיין יכולים לשלב את הלימודים במסלול החיים שלהם. חשוב לציין כי כדאי לברר אילו תוכניות לימוד מציע כל מוסד לימודים לפני שאתם מקבלים החלטה, וכך תוכלו למצוא את הלימודים המתאימים לכם ביותר.

משך הלימודים לתואר שני בלימודי ארץ הוא בין שנה לשלוש שנים. במסגרת הלימודים, יכולים הסטודנטים לפנות למספר מסלולים, שמשפיעים על משך הלמידה של כל סטודנט. במסלול עיוני ללא תזה רוב התוכניות נפרשות על פני שנה עד שנתיים, ובמסלול מחקרי הכולל תזה רוב התוכניות נמשכות בין שנתיים לשלוש בדרך כלל.

במוסדות לימוד רבים הלימודים נערכים פעם בשבוע באופן מרוכז, אך הדבר עשוי להשתנות בין מוסד אחד למשנהו. באופן כללי, גם משך הלימודים וגם המבנה שלהם אינם זהים במוסדות הלימודים השונים. לכן, כדאי לברר את הפרטים המדויקים מול מוסדות הלימוד שמעניינים אתכם. באופן זה תוכלו לעשות השוואה ולמצוא היכן הכי מתאים לכם ללמוד.

מוסדות הלימוד אשר מציעים לימודים מתקדמים בלימודי ארץ ישראל מקיימים מסלולי לימוד עם תזה שבהם הסטודנט עורך מחקר על נושא שיבחר בליווי מנחה. במהלך התואר, התלמידים ישתתפו בסמינריונים על פי בחירה או בהתאם לתוכנית. נושאי סמינריונים נפוצים יכולים להיות: טבע ונוף במקרא, שינויים טכנולוגיים בתקופות מסוימות בארץ ישראל, ארכיאולוגיה של תקופות מסוימות וכן הלאה.

אפשרות נוספת היא לימודים לתואר שני במסלול בלי תזה במסגרתם ילמדו קורסים שונים, וכן התלמידים ייקחו חלק בסמינריונים שונים ויצאו לסיורים מונחים כחלק מתוכנית הלימודים. במוסדות מסוימים מציעים מסלולי לימוד ייחודיים כמו מסלול ללא תזה למורים ולמורי דרך. המסלול הייחודי מיועד להעשיר את ידע המורה ולהעלות את איכות ההוראה שלו בתחומים השייכים. במסלולים אלו לרוב ניתן למצוא קורסים בנושאים הבאים: תקופת המקרא, התקופה הצלבנית, טופוגרפיה, גיאוגרפיה פיסית ועוד.