תחום הנדסת הסביבה עוסק בהבנת התהליכים הכימיים והביולוגיים המעורבים בהנדסת איכות המים, בזיהום אוויר וזיהום מים, בקרה ושליטת חומרים מסוכנים, חשיפת האדם לזיהום וחומרים מזהמים, ביוטכנולוגיה סביבתית ובפיתוח טכנולוגיות להפחתת זיהום ושמירה על איכות הסביבה. ניתן לחלק את הנדסת הסביבה לפי שלוש קטגוריות, המשפיעות על הסביבה וכן משפיעות האחת על השנייה.

מהנדס הסביבה חוקר את הקשר שבין שלושת המרכיבים כשהראשון הוא בנייה סביבתית, השני הוא אנרגיה ואטמוספירה והשלישי הוא מאגרי מים וסביבותיו. בנייה סביבתית מכילה נושאים כמו הנדסת בניין ורעידות אדמה, בנייה ירוקה ובנייה בת קיימא, ניתוח מעגלי חיים, ניהול סיכונים של אזורי חוף, מחזור מים ועוד. לאנרגיה ואטמוספירה נכנסים נושאים משיקים, כמו בנייה ירוקה ובת קיימא, וכן ישנם נושאים כמו אקלים ומזג אויר, מחזור אנרגיה, איכות אוויר, מדיניות סביבתית ומימן ואנרגיה מבוזרת. בסביבת מים משתלבים נושאים כמו ביוטכנולוגיה סביבתית, מדיניות סביבתית, ניהול סיכונים באזורי חוף, מחזור מים, איכות מים ועוד. כאמור, שלושת הקטגוריות אינן נפרדות ומהנדס הסביבה נדרש לראייה מקיפה ומערכתית של כלל הגורמים והמשפיעים בעבודתו.

הלימודים מיועדים לבעלי תואר ראשון בהנדסה או במדעיים מדויקים בתחומים משיקים כמו כימיה, גיאוגרפיה ופיזיקה. על מנת להגיש מועמדות ללימודים, על הפונים להחזיק בממוצע של 80 ומעלה בציוני התואר הראשון. עם זאת, תנאי הקבלה עשויים להשתנות מעת לעת ומתכנית לתכנית ועל כן יש להתעדכן בתנאי הקבלה המדויקים אצל מזכירות החוג. לתלמידים שחסרים ידע ביסודות ההנדסה הסביבתית, כמו למשל בתרמודינמיקה, במכניקת הזורמים, במשוואות דיפרנציאליות חלקיות ובנושאים אחרים, תבנה תכנית השלמה בהתחשב ברקע התלמיד ובהחלטת המחלקה. 

הנדסה סביבתית לתואר M.Sc. או לתואר M.E. ניתן ללמוד בשני מסלולים, מסלול מחקרי ומסלול לפרויקט גמר. בשני המסלולים התלמידים לוקחים חלק בשיעורי חובה מהפקולטה ושיעורי ליבה מהתכנית וכן, הם משתתפים בשיעורי בחירה מן החוג ומחוגים מדעיים אחרים. תלמידים בנתיב המחקרי בוחרים את קורסי הבחירה בעצת מנחה התזה שלהם. בנוסף על כך, תלמידי שני המסלולים נדרשים להשתתף בסמינרים מחלקתיים, ובתום הלימודים תלמידי המסלול המחקרי יגישו עבודת גמר מחקרית ויציגו תזה, ואילו תלמידי המסלול השני יכינו פרויקט סיום שאינו מחקרי בהיקף של עבודה סמינריונית. מסיימי המסלול המחקרי בהצלחה יכולים להמשיך לעבר לימודי דוקטורט בהנדסה אזרחית, ולהצטרף לסגל המחקר וההוראה במוסדות להשכלה גבוהה בארץ ובעולם.

בעלי תואר שני בהנדסה אזרחית, הנדסת סביבה, יכולים להשתלב במקומות עבודה רבים ומגוונים. למשל בחברות בנייה והנדסה פרטיות, בגופים ציבוריים וממשלתיים שעניינם בבנייה, בתכנון ובפיקוח של מבנים ומחקר באיכות סביבה, ברשויות מקומיות, במפעלי תעשייה, בארגונים חקלאיים וכיועצים לחברות ולגופים שונים בנושאי איכות סביבה ובנייה בת קיימא. מהנדסי סביבה הם מתכנני מערכות ומקבלי ההחלטות בנושאים הקשורים בהגנה על מקורות מים, בבקרת זיהום אוויר ממקורות שונים, בטיפול בשפכים, בהטפלת מים, בסילוק ומחזור של פסולת מסוגים שונים ובצמצום זיהום בתהליכי ייצור תעשייתי. כמובן שבפני מסיימי התואר, במיוחד במסלולים המחקרים, פתוחה האפשרות להשתלב במחקר האקדמי במכוני מחקר ברחבי העולם וכן להמשיך ללימודי דוקטורט ולהצטרף לצוותי ההוראה והמחקר במוסדות להשכלה גבוהה. בנוסף על כך, למהנדסי סביבה בעלי תואר שני ישנה אפשרות לשמש כמשקיפים וכמפקחים על יישום החלטות וחוקים מדינתיים בנושאי איכות סביבה במפעלים ובפרויקטים ציבוריים, ולהצטרף ללובי המפעיל לחץ פרלמנטרי בנושאי איכות סביבה.